Die Nähe zur dänischen Grenze gibt besondere Impulse. Der intensive Grenzhandel ist eine Besonderheit, von der die Stadt profitiert, aber auch von den immer mehr werdenden Niederlassungen skandinavischer Unternehmen im Grenzland. Durch die deutsch-dänische Zusammenarbeit und der regionalen Nähe sind die dänischen Nachbarn häufige Kund:innen und Gäste der Flensburger Unternehmen.

Wie in Lübeck wird auch in Flensburg eng mit den Hochschulen und den Unternehmen der Leitbranchen, den Cluster-Organisationen und den Transfereinrichtungen am Standort (wie etwa das Jackstädt-Zentrum) zusammengearbeitet, beispielsweise durch die Einbindung von Unterstützern und Mentor:innen aus der Wirtschaft.